Pôle : MICSOL                                         Equipe/Thème dans le pôle :  Biocom / écologie microbienne

Tel :  03.80.69.34.36                                 E-Mail  : solene.perrin@inrae.fr

Curriculum vitae :

Diplômes:

2014-2016 : Baccalauréat Sciences et Techniques de Laboratoires, Spécialité Biotechnologies                                                        
2016-2018 : Brevet de Technicien Supérieur, spécialité Bioanalyses et contrôles
2019-2020 : Licence professionnelle mention Bio-Industries et biotechnologies parcours Culture de Tissus et de Cellules et Biologie Moléculaire (CTCBM)

Expériences:

Depuis 2020 : CDD Assistante Ingénieure (INRAE Dijon; UMR Agroécologie; Equipe BIOCOM)              

2019-2020 : Apprentie licence pro CTCBM / Plateforme GenoSol (INRAE Dijon; UMR Agroécologie)               

2018-2019 : CDD Technicienne de Recherche / Plateforme GenoSol (INRAE Dijon; UMR Agroécologie)         

Compétences:

Compétences techniques : biologie moléculaire et bases techniques en microbiologie, biologie cellulaire, biochimie, analyse de donnée (Excel, Word, Access) et analyse d’image (ImageQuant, UVITEC, Magellan)

Gestion : logistique et organisation de projet en relation avec les scientifiques, gestion de consommables et du parc d’équipement, prise de contact et échange avec les fournisseurs

Démarche qualité et métrologie : traçabilité des données (cahier de laboratoire, base de donnée), vérification de pipette, tunnel des balances

Activités de recherche, techniques  :

Analyses moléculaires des communautés bactériennes et fongiques dans les sols :
- Extraction et purification ADN des microorganismes du sol
- Mesure de l’abondance des microorganismes du sol : électrophorèse sur gel d’agarose, révélation au BET
- Etude de la densité bactérienne et fongique : PCR quantitative
- Etude de la diversité bactérienne et fongique : préparation de banques destinées au séquençage nouvelle génération (PCR, vérification sur gel, purification de PCR, mélange équimolaire)
- Analyses statistiques permettant la validité technique des résultats obtenus (Excel et/ou Rstudio)
- Mise au point de techniques de biologie moléculaire, évolution des protocoles existants
- Formation technique de stagiaire bac+2 (BTS, IUT)

Publications :

Van Schaik, E., Mondy, S., Lelievre, M., Martin, M., Perrin, S., Meredith, L., Kaisermann, A., Jones, S., Rue, O., Loux, V. & Wingate, L. (2020). Revealing how nitrogen fertilisation regulates the fluxes of COS and CO2 between soil communities and the atmosphere using a functional metagenomic and metatranscriptomic approach (No. EGU2020-21605). Copernicus Meetings.

Dunn, L., Lang, C., Marilleau, N., Terrat, S., Biju-Duval, L., Lelièvre, M., Perrin, S. & Chemidlin Prévost-Bouré, N. (2021). Soil microbial communities in the face of changing farming practices: A case study in an agricultural landscape in France. PLoS One, 16(6), e0252216.

Liens externes:

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