Activités de recherche: 

J’effectue ma recherche au sein de l’UMR Agroécologie, au centre INRAE de Bourgogne Franche-Comté à Dijon, au sein de l’équipe « Holobionte ». Nous travaillons à étudier la plante et les communautés microbiennes qui lui sont associées en les considérant comme une seule et même entité biologique : un holobionte. Ma recherche porte plus particulièrement sur la compréhension du rôle du microbiote rhizosphérique dans l’écologie et la santé des plantes.

Activités d’enseignement  : 

Enseignant-chercheur à l’Université de Bourgogne, je suis impliqué dans l’enseignement de la biologie végétale et de l’écologie microbienne du sol. Je participe aux enseignements visant à décrire les organismes végétaux dans leurs diversités et leurs anatomies, mais aussi les interactions qu’ils entretiennent avec l’environnement et les autres organismes, notamment le microbiote du sol (bactéries et champignons). J’enseigne également l’analyse des communautés (diversité, structure) et des réseaux d’interactions entre les espèces microbiennes associées étroitement aux plantes.

Publications :

Publication depuis 2020 :
(1)        Mortier E, Jacquiod S, Jouve L, Martin-Laurent F, Recorbet G, Olivier Lamotte O. (2023). Micropropagated walnut dependency on phosphate fertilization and arbuscular mycorrhiza for growth, nutrition and quality differ between rootstocks both after acclimatization and post-acclimatization Sci. Hortic.318: 112081.
(2)        Kalachova T, Jindřichová B, Burketová L, Monard C, Blouin M, Jacquiod S, Ruelland E, Puga-Freitas R. (2023). Controlled natural selection of soil microbiome through plant-soil feedback confers resistance to a foliar pathogen. Plant Soil. https://doi.org/10.1007/s11104-022-05597-w
(3)        Jacquiod S, Spor A, Wei S, Munkager V, Bru D, Sørensen JS, Salon C, Philippot L, Blouin M. (2022). Artificial selection of stable rhizosphere microbiota leads to heritable plant phenotype changes. Ecol. Lett. 25: 189-201.
(4)        Jacquiod S, Raynaud T, Pimet E, Ducourtieux C, Casieri L, Wipf D and Blouin M. (2022). Wheat Rhizosphere Microbiota Respond to Changes in Plant Genotype, Chemical Inputs, and Plant Phenotypic Plasticity. Front Ecol Evol. 10:903008. doi: 10.3389/fevo.2022.903008.
(5)        Jacquiod S*, Wei S*, Philippot L, Blouin M, Sørensen JS. (2021). Spatial analysis of the root system coupled to microbial community inoculation shed light on rhizosphere bacterial community assembly. Biol Fertil Soils. 57:973–989.
(6)        Pivato B, Semblat A, Guégan T, Jacquiod S, Martin J, Deau F, Moutier N, Lecomte C, Burstin J, Lemanceau P. (2021). Rhizosphere Bacterial Networks, but Not Diversity, Are Impacted by Pea-Wheat Intercropping. Front Microbiol. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.674556.
(7)        Kang D, Shoaie S, Jacquiod S, Sørensen JS, Ledesma-Amaro R. (2021). Comparative Genomics Analysis of Keratin-Degrading Chryseobacterium Species Reveals Their Keratinolytic Potential for Secondary Metabolite Production. Microorganisms. 9:1042.
(8)        Meisner A, Snoek BL, Nesme J, Dent E, Jacquiod S, Classen AT, Priemé A. (2021). Soil microbial legacies differ following drying-rewetting and freezing-thawing cycles. ISMEj. 15:1207–1221
(9)        Balbín-Suárez A, Jacquiod S, Rohr AD, Liu B, Flachowsky H, Winkelmann T, Beerhues L, Nesme J; Sørensen JS; Vetterlein D; Smalla K. (2021). Root exposure to apple replant disease soil triggers local defense response and rhizoplane microbiome dysbiosis. FEMS Microbiol Ecol. 97:fiab031.
(10)      Kang D, Huang Y, Nesme J, Herschend J, Jacquiod S, Kot W, Hansen LH, Lene Lang L, Søren JS. (2020). Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanism. Sci. Total Environ. 761:143281.
(11)      Balbín-Suárez A, Lucas M, Vetterlein D, Sørensen SJ, Winkelmann T, Kornelia Smalla K, Jacquiod S. (2020). Exploring microbial determinants of apple replant disease (ARD): A microhabitat approach under split-root design, FEMS Microbiol Ecol. fiaa211.
(12)      Blouin M, Jacquiod S. (2020). Sampling the control bulk soil for rhizosphere and drilosphere microbial studies. Geoderma. 380: 114674
(13)      Jacquiod S, Puga-Freitas R, Spor A, Mounier A, Monard C, Mougel C, Philippot L, Blouin M. (2020). A core microbiota of the plant-earthworm interaction conserved across soils. Soil Biol Biochem. 144:107754.
(14)      Gonzalo M, Espersen R, Al-Soud WA, Cristiano Falco F, Hägglund P, Sørensen SJ*, Svensson B*, Jacquiod S*. (2020). Azo dying of α-keratin material improves microbial keratinase screening and standardization. Microb Biotechnol. 13:984-996. doi: 10.1111/1751-7915.13541.
(15)      Nasipuri P, Herschend J, Brejnrod AD, Madsen JS, Espersen R, Svensson B, Burmølle M, Sørensen SJ*, Jacquiod S*. (2020). Community-intrinsic properties enhance keratin degradation from bacterial consortia. PLoS One. 15:e0228108.
(16)      Jacquiod S*, Cyriaque V*, Riber L, Abu Al-Soud W, Gillan DC, Sørensen SJ, Wattiez R. (2020). Selection and propagation of IncP conjugative plasmids following long-term anthropogenic metal pollution in river sediments. J Hazard Mater. 382:121173.
(17)      Kang D, Jacquiod S, Herschend J, Wei S, Nesme J, Sørensen SJ. (2020). Construction of Simplified Microbial Consortia to Degrade Recalcitrant Materials Based on Enrichment and Dilution-to-Extinction Cultures. Front Microbiol. 10:3010.
(18)      Jacquiod S*, Elsayed TR*, Nour EH, Sørensen SJ, Smalla K. (2020). Biocontrol of Bacterial Wilt Disease Through Complex Interaction Between Tomato Plant, Antagonists, the Indigenous Rhizosphere Microbiota, and Ralstonia solanacearum. Front Microbiol. 10:2835.

Principaux contrats :

- 2021 : Projet « HOLOSTRESS » (Graduate School TRANSBIO). Rôle : Participant (écriture). Coordinateur : Romain Barnard.

- 2019 : Lauréat I-SITE Junior Fellowship BFC. Projet « EMERGE : Interaction Plantes-Microorganismes ». Rôle : Coordinateur.

- 2018 : Projet « MULCH CATALYSE - Paillages bio-stimulants 100% naturels ». Programme d’Investissement d’Avenir (PIA3). UMR Agroécologie, Centre INRAE BCF Dijon. Rôle : Participant (écriture et contractuel). Coordinateur : Fabrice Martin.

- 2016 : Projet « SELECT – Sélection artificielle de microbiote rhizosphériques impactant le phénotype des plantes ». Financement régional FABER. UMR Agroécologie, Centre INRAE BCF Dijon. Rôle : Participant (contractuel). Coordinateur : Manuel Blouin.

Liens externes  : 

Google scholar: https://scholar.google.com/citations?user=prS1tsQAAAAJ&hl=f